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　　无论在健康还是疾病研究领域，基因表达的调控几乎是所有生物学过程的基础。《基因调控机制》旨在将当前对基因表达调控机制的认知加以浓缩概述，不仅对经典的转录机器、转录调控、信号转导及染色质修饰等进行了精细深入的阐释，而且着重定位于描述后基因组时代的基因调控。《基因调控机制》体现了当前国际上基因表达调控研究的水平和动向，英文原著在国际学术界有较大影响，可供生物学、基础医学等学科的研究生学习和参考。

篇 概述

第1章 介绍：什么是基因表达？

  1.1 分子生物学的中心法则

  1.2 基因转录的复杂性

  1.3 转录调控元件

  1.4 染色质活动在基因调控中的作用

  1.5 基因表达程序

  1.6 主要概念

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第2章 染色质的功能

  2.1 常染色质和异染色质

  2.2 核小体

  2.3 染色质开放和封闭时的组蛋白修饰

  2.4 组蛋白修饰的基因组效应

  2.5 染色质结构

  2.6 表观遗传信号对健康和疾病的影响

  2.7 主要概念

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第二篇 转录因子篇

第3章 基础转录机器

  3.1 核心启动子

  3.2 TATA框

  3.3 核心启动子元件

  3.4 TFⅡD作为多蛋白复合物的范例

  3.5 基因组范围内识别核心启动子的方法

  3.6 中介复合物

  3.7 主要概念

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第4章 转录因子

  4.1 位点特异性转录因子

  4.2 转录因子结构域

  4.3 二聚体化的转录因子复合物：核受体异源二聚体的例子

  4.4 生物信息学方法识别转录因子结合位点

  4.5 转录因子表达谱

  4.6 转录因子的分类

  4.7 主要概念

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第5章 信号转导与基因调控

  5.1 潜在转录因子的激活

  5.2 转录因子网络

  5.3 转录因子调控的程序性细胞分化

  5.4 NFKB信号途径

  5.5 炎症反应中的转录因子

  5.6 感应细胞压力：p53途径

  5.7 主要概念

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第6章 基因表达开关：核受体的例子

  6.1 核受体超家族

  6.2 核受体的分子间相互作用

  6.3 核受体的生理作用

  6.4 核受体及其配体

  6.5 核受体和辅因子的相互作用

  6.6 主要概念

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第7章 基因组作图

  7.1 进化足迹法

  7.2 ENCODE计划

  7.3 ENCODE计划的数据挖掘

  7.4 整合ChIP-seq数据

  7.5 转录因子的其他DNA结合模式

  7.6 转录因子与靶基因的匹配

  7.7 主要概念

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第三篇 染色质篇

第8章 染色质修饰因子

  8.1 组蛋白密码模型

  8.2 组蛋白修饰酶

  8.3 组蛋白标记的全基因组分析和它们的修饰酶

  8.4 染色质修饰和疾病

  8.5 主要概念

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第9章 基因组印记

  9.1 绝缘子

  9.2 基因组调节CTCF

  9.3 基因组印记

  9.4 绝缘子功能模型

  9.5 CTCF介导的染色质结构的遗传

  9.6 主要概念

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第10章 表观基因组

  10.1 DNA甲基化

  10.2 基因组范围的DNA甲基化

  10.3 DNA甲基化、异染色质和基因沉默

  10.4 健康与疾病中的表观基因组学

  10.5 主要概念

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第11章 染色质重塑

  11.1 染色质重塑的作用

  11.2 ATP-依赖的重塑复合物

  11.3 启动子上的核小体定位

  11.4 先锋因子

  11.5 转录动力学和噪声

  11.6 主要概念

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第12章 染色质结构

  12.1 细胞核的组织

  12.2 高级DNA环结构的形成

  12.3 细胞核内的分区

  12.4 转录工厂

  12.5 核定位与疾病

  12.6 主要概念

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第四篇 非编码RNA篇

第13章 调控RNA

  13.1 非编码RNAs

  13.2 miRNA及其功能

  13.3 长链非编码RNA

  13.4 eRNA

  13.5 miRNA和转录因子介导的基因调控

  13.6 主要概念

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　　秦玉琪，山东大学国家糖工程技术研究中心，长期从事真核生物遗传学和功能基因组学的研究、特别侧重于真核生物转录调控的研究，对转录调控参与真核生物发育以及组蛋白修饰参与染色质重构具有深入研究。

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编辑推荐

　　《基因调控机制》内容以2001年以来一直由C. Carlberg教授在东芬兰大学教授的课程“基因表达的调控机制”为基础，分别从转录因子、染色质和非编码RNA的视角对基因调控作以概述。除了对生物学原理进行阐述以外，着重在新成果的总结方面。

前言

本书主要讲述真核生物基因的调控。基因表达塑造了细胞和组织的表型；无论在健康还是疾病研究领域，基因表达的调控几乎是所有生物学过程的基础。因此，不仅生物学家和生物化学家应该深入探索基因调控的原理，生物医药领域的学生也应该了解此研究领域，从而获得良好的专业学科基础。对转录因子及其活性改变过程的完整认知是现代生命科学研究的一个基本目标。对整个人类基因组序列（以及其他真核生物基因组序列）的利用，以及第二代测序技术的发展，已经明显改变了生物科学的几乎所有领域。例如，由DNA元件百科全书计划提供的基因组范围内的组蛋白修饰定位和转录因子结合位点定位的研究，极大地促进了我们对基因调控的理解。因此，本书着重定位于描述后基因组时代的基因调控。不同于Ben Lewin的《基因》一类的经典分子生物学书籍，本书的目的是将当前对基因表达调控机制的认知加以浓缩概述，汇聚精华。鉴于“一图胜千言”，本书中使用了大量的图示。本书的内容以2001年以来一直由C.Carlberg教授在东芬兰大学教授的课程“基因表达的调控机制”为基础，分为4大部分，13个章节。在总体介绍之后的三部分，分别从转录因子、染色质和非编码RNA的视角对基因调控加以概述。本书的内容适用于生命科学的硕士研究生，但同样适用于其他生物、医学学科的学生以及博士研究生。本书有以下四点目标，学生应该：1.对基因结构、染色质构成、转录因子以及它们的调控机制有深入理解。2.识别影响基因表达的主要成分、机制和过程，以及调控基因表达复杂性的多个层次。3.有能力分析转录因子、它们的共调控因子以及与它们表达相关的非编码RNA，以此来判断它们在真核生物基因表达调控中的影响。4.应用基因调控中的知识来设计、开展和分析实验，比如：定量PCR、微阵列和染色质免疫共沉淀。我们希望读者能够喜欢这本书，并对基因表达调控机制的研究产生浓厚的兴趣。

2013年8月于Kuopio

Carsten Carlberg 和 Ferdinand Molnár